Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP27XA6NNY8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP27XA6NNY8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP27XA6NNY8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP27XA6NNY8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms