Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RTL1A6NKG5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RTL1A6NKG5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RTL1A6NKG5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RTL1A6NKG5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms