Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAC3D1A6NKF1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAC3D1A6NKF1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAC3D1A6NKF1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAC3D1A6NKF1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAC3D1A6NKF1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SAC3D1A6NKF1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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