Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC69A6NI79 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC69A6NI79 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC69A6NI79 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms