Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPOPA6NHQ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPOPA6NHQ4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPOPA6NHQ4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPOPA6NHQ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPOPA6NHQ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EPOPA6NHQ4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPOPA6NHQ4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPOPA6NHQ4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EPOPA6NHQ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPOPA6NHQ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPOPA6NHQ4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPOPA6NHQ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPOPA6NHQ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms