Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBAL3A6NHL2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBAL3A6NHL2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms