Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PSDA5PKW4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PSDA5PKW4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PSDA5PKW4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PSDA5PKW4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms