Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTAGE9A4FU28 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTAGE9A4FU28 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE9A4FU28 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms