Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms