Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIPSLA2A3N6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIPSLA2A3N6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIPSLA2A3N6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIPSLA2A3N6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms