Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPDC1A2A3K4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPDC1A2A3K4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPDC1A2A3K4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms