Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM72A0PK05 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM72A0PK05 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.2 ms