Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR11

CENPVL1, Centromere protein V-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1A0A0U1RR11 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPVL1A0A0U1RR11 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPVL1A0A0U1RR11 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPVL1A0A0U1RR11 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms