Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RQJ8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RQJ8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQJ8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms