Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV27A0A087WT01 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV27A0A087WT01 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV27A0A087WT01 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV27A0A087WT01 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV27A0A087WT01 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV27A0A087WT01 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV27A0A087WT01 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV27A0A087WT01 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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