Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA3Q9Y6H8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms