Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms