Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms