Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms