Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNND2Q9UQB3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms