Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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TPCN1Q9ULQ1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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TPCN1Q9ULQ1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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TPCN1Q9ULQ1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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TPCN1Q9ULQ1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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TPCN1Q9ULQ1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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TPCN1Q9ULQ1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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TPCN1Q9ULQ1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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TPCN1Q9ULQ1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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TPCN1Q9ULQ1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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TPCN1Q9ULQ1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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TPCN1Q9ULQ1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPCN1Q9ULQ1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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