Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms