Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT7Q9UIV1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT7Q9UIV1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms