Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF639Q9UID6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF639Q9UID6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms