Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms