Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms