Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD2Q9UBB5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms