Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms