Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MARCH4Q9P2E8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MARCH4Q9P2E8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms