Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms