Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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