Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms