Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB3GAP2Q9H2M9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP2Q9H2M9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms