Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms