Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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