Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms