Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms