Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms