Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms