Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPOCK3Q9BQ16 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms