Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms