Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms