Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIC2Q96JB3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms