Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCMH1Q96GD3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms