Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms