Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HPS3Q969F9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms