Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms