Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms