Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms