Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms