Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms